Hier jetzt die Lösung.
Ich habe in das Mainboard BIOS ein neueres BIOS für den Sil3114 Controller geflasht.
Anschließend muss man noch die eingerichteten JBOD Sets aus den einzelnen Platten im Controller entfernen. Dadurch werden die Platten nicht mehr den BIOS gemeldet und das Board denkt es hätte nur 4 Platten.
Mit dem neuen Sil3114 BIOS sind aber die Platten jetzt in Windows zugreifbar. Außerdem kann man jetzt auch direkt Platten dranhängen und umstöpseln ohne die beim Booten einmal einrichten zu müssen.
Ein bisschen arm, dass Asus das nicht gleich fertig anbietet.