Da wären die Basics erstmal interessant.
Welcher E-Mail Anbieter?
Welcher E-Mail Client?
Eventuell auch welches Betriebssystem?
An sonsten kann ich mich noch grob daran erinnern dass die E-Mails beim POP3 Zugang runtergeladen und bei IMAP auf dem Server bearbeitet werden. Läßt dein E-Mail Client also die lokale Archivierung zu könnte man es gleich so erledigen. Bei der Gelegenheit könnte man auch nach einer Backup Funktion für den E-Mail Client schauen. Für Thunderbird und Mozilla hatte ich früher gern MozBackup verwendet.