News SETI.Germany : TN-Grid: neue WUs zur Weinrebe

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Wie zum Ende der letzten WU-Serie angekündigt, werden seit inzwischen etwa zwei Wochen neue WUs verteilt. Diese beschäftigen sich nun wieder mit dem Genom der Weinrebe (Vitis vinifera), welches das Projekt auch in der Vergangenheit schon behandelte (siehe hier und hier). Ein Flaschenhals ist weiterhin die WU-Erzeugung, alle frischen WUs werden praktisch sofort verschickt. Dennoch werden die Berechnungen vermutlich innerhalb weniger Monaten abgeschlossen.

Vespucci-2023-Vitis-vinifera-OneGenE-Experiment
Das Vespucci-2023-Vitis-vinifera-OneGenE-Experiment hat offiziell begonnen, weitere wissenschaftliche Informationen dazu findet ihr in diesem Thread: https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=370 (engl.)
Danke euch allen für eure Unterstützung!
15.05.2023, 18:14:30 MEZ


Zum wissenschaftlichen Hintergrund aus dem verlinkten Thread übersetzt:

Das neue Vitis-vinifera-Projekt läuft
Hallo zusammen, ich freue mich sehr bekanntzugeben, dass ein neuer, größerer Datensatz der transkriptomischen Vitis-vinifera-Daten (Vespucci) zur Erweiterung mit OneGenE verfügbar ist. Die Anzahl der Experimente hat sich mehr als verdreifacht. Wir verwenden noch immer die Ergebnisse der vorherigen Auswertungen und finden dabei sehr interessante Genassoziationen und erstellen erstaunliche Gennetzwerke. Wir erwarten nun, diese mit diesem neuen Satz von Durchläufen verbessern und verfeinern zu können. Vielen Dank euch allen.
Falls ihr euch für die Architektur des transkriptomischen Datensatzes interessiert, schaut bitte diesen Artikel an: https://doi.org/10.3389/fpls.2022.815443 (engl.)
12.05.2023, 17:26:14 MEZ


Originaltexte:
Zitat
Zitat von The Vespucci-2023 Vitis vinifera OneGenE experiment
The Vespucci-2023 Vitis vinifera OneGenE experiment is officially started, for more scientific info about it please look at this thread https://gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=370.
Thank you all for your support!
15 May 2023, 17:14:30 UTC
Zitat
Zitat von The new Vitis vinifera project is underway
Dear all, I am very excited to announce that a new bigger dataset of Vitis vinifera transcriptomic data (Vespucci) is now available for OneGene expansion. The number of experiments has more than tripled. We are still using the results from the previous analyses, finding very interesting gene associations and producing amazing gene networks. We now expect to improve and refine them with this new collection of runs. Many thanks to all of you.
If you are interested in the architecture of the transcriptomic dataset, please look at the following article: https://doi.org/10.3389/fpls.2022.815443
12 May 2023, 16:26:14 UTC

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