Problem ist nicht, dass du damit Arbeit hast, die Kiste zu plätten, sondern, dass du im jetzigen Zustand nicht sicher sein kannst, dass die Kiste verseucht ist und evtl. sogar Daten gefährdet sind oder Passwörter abgegriffen werden können.
Mach dir lieber einmal (mehr) die Arbeit und zieh vom sauberen System ein Image, das du in einem derartigen Fall wiederherstellen kannst. Es gibt nun wirklich genügend Image-Programme, sowohl kostenlose als auch Löhnware.
MfG Dalai