RNA-World Deadline zu kurz

JagDoc · 21.10.2012

Bitte verlängern:

http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6067610

Danke
cu JagDoc

yoyo · 21.10.2012

Verlängert

Sightus · 12.11.2012

yoyo · 12.11.2012

Sightus · 14.11.2012

14.11.2012 03:28:36 RNA World Task cms_GA-p[e30-50MB_Lin64s]_1_Pan-troglodytes-(chimpanzee)_BA000046.lin.EMBL_RF00028_Intron_gpI_1316375560_104300_23 exited with zero status but no 'finished' file

Die WU hatte schon gut was auf dem Buckel; Rechner lief einwandfrei...

JagDoc · 20.11.2012

Bitte verlängern:

http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6078137
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6076863

Danke
cu JagDoc

yoyo · 20.11.2012

verlängert

Sightus · 21.11.2012

Ich entschuldige mich mal im vorwege, dass ich hier poste, aber ich habe ein Frage zu den WUs.

Da die Laufzeiten ja mitunter "lang" sind und es fast nicht möglich ist aktive Systeme so lange ohne Neustart online-fähig zu halten, kam mir die Frage, ob man nicht virtuelle Maschinen nutzen könnte. Ich würde dann je Host eine große VM erstellen, die WU darin berechnen lassen und falls das Host-System booten muss, die VM in den Ruhezustand versetzen.
Hat das jemand mal ausprobiert? Laufen die WUs dann nahtlos weiter? Sind die Ergebnisse valide? Ich hatte private mal eigene Simulationen in VMs und da überstande die Berechnungen nicht immer den Ruhezustand. Und bevor ich jetzt Stunden in einer VM rechnen lasse, welche dann nur Müll berechnet, frage ich lieber.

Gruß sightus

Rebirther · 21.11.2012

Sightus schrieb:
Ich entschuldige mich mal im vorwege, dass ich hier poste, aber ich habe ein Frage zu den WUs.

Da die Laufzeiten ja mitunter "lang" sind und es fast nicht möglich ist aktive Systeme so lange ohne Neustart online-fähig zu halten, kam mir die Frage, ob man nicht virtuelle Maschinen nutzen könnte. Ich würde dann je Host eine große VM erstellen, die WU darin berechnen lassen und falls das Host-System booten muss, die VM in den Ruhezustand versetzen.
Hat das jemand mal ausprobiert? Laufen die WUs dann nahtlos weiter? Sind die Ergebnisse valide? Ich hatte private mal eigene Simulationen in VMs und da überstande die Berechnungen nicht immer den Ruhezustand. Und bevor ich jetzt Stunden in einer VM rechnen lasse, welche dann nur Müll berechnet, frage ich lieber.

Gruß sightus

Das hatte ich früher mal mit dem alten vmware server probiert (suspend), man muss aber die WU vorher pausieren, denn beim Wiederaufnehmen ist die Platte etwas lahmer, da dauert es lange bis die VM wieder aktiv ist aber die WU lief schon vorher schneller und brach mit Fehler ab. Des weiteren muss man noch die Uhr einstellen (war ein Ubuntu System)

Sightus · 12.12.2012

Ich werde demnächst mal die VM-Umgebung ausprobieren. Was mich gerade ein wenig beschäftigt; ich habe gerade mehrere Rechner zu RNA geswitcht und ich frage mich, ob ich wirklich jede einzelne WU hier melden muss, die augrund einer viel zu kurzen Deadline nicht fertig wird. Könnte man nicht ferner alle WU unter meinem Namen verlängern? Würde mir eine Menge Gesuche ersparen.... :-*

yoyo · 13.12.2012

Welcher Userid hast du denn?

yoyo

JagDoc · 16.12.2012

Bitte verlängern:

http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6088411

Danke
cu JagDoc

yoyo · 16.12.2012

Sightus · 26.12.2012

Emploi · 26.12.2012

Und ich jammere rum das mein Llano ein paar Monate umsonst lief, wenn das die Grünen sehen ^^.

yoyo · 26.12.2012

Sightus schrieb:
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6080547
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6061200
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6088270
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6023659
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6097280
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6092135
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6053432
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6034028
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098562
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098560
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6083288
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6027403
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6028857
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5810657
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6011745
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6028713
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5998324
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6022210
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6097422
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6098704
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6095992
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6084436
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6027401
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5801935
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6069067
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6029995

Gruß Sightus

PS: Ein paar sind leider schon abgelaufen; es sind einfach zu viele WUs zum mal eben "drüberschauen"

verlängert.
Kannst mir auch die abgelaufenen melden, wenn sie noch bei dir laufen. Mein Verlängerungsscript reaktiviert die.

yoyo

JagDoc · 26.12.2012

@yoyo
Kannst du dir bitte diese WU mal anschauen:
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5810657

Beim Rechner 10636 von thorsam steht "Completed, marked as invalid" obwohl ein zweiter Rechner "Completed and validated" hat.

Danke
cu JagDoc

yoyo · 26.12.2012

ich weiss nicht genau, was den Validator da geritten hat, aber ich hab mal die Credits gegranted.
yoyo

Sightus · 26.12.2012

Danke! Erstmal leider nicht mehrgefunden (bin im Moment nur per Smartphone online)

http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5807314

@Emploi

yoyo · 26.12.2012

Sightus schrieb:
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=5807314

Erfolgreich reanimiert und verlängert.

Sightus · 27.12.2012

Vielen Dank! Ich versuche mir mal einen Überblick zu verschaffen, denn das waren ja erstmal die WUs, die bis Neujahr hätten fertig sein müssen. Ein noch größerer Schwung hat eine Deadline im Januar.

Gruß sightus

PS: 400k pending.

Sightus · 02.01.2013

yoyo · 02.01.2013

verlängert und reaktiviert

Sightus · 04.01.2013

Bitte verlängern:
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6108797
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6111393
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6035196
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=6033883

Danke.

yoyo · 04.01.2013

RNA-World Deadline zu kurz

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