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How to install the app on iOS
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Hab auch jede Menge abgefaßt!
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Und wie machen sich die?
JKuehl
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bin auch wieder am start
Derzeit alles HMMPFAM 5.11 Wus.
Q6600 @3.5 Ghz:
2972 Credits am Tag wenn man das hochrechnet - also rund auf dem Niveau von POEM.
Beschreibung
Mittels HMMER werden ähnliche Gen- oder Proteinsequenzen charakterisiert, bzw. Profile davon erstellt, und in Proteinfamilien eingeteilt. Dabei werden bereits bekannte Funktionen als Vorlage genommen, und neu entdeckte, unbekannte Proteine in die gleiche Gruppe klassifiziert.
Im speziellen handelt es sich hier um fast 7 Millionen Sequenzen von rund 41000 Organismen der RMIDb. Diese Datenbank besteht aus Datensätzen von fast allen großen Proteindatenbanken - und mittels hmmpfan wird eine Klassifizierung vorgenommen. Das Problem besteht darin, dass die Datenbanken alle unterschiedliche Kriterien für die Klassifizierung anlegen, und somit eine Neuberechnung erforderlich ist.
Die Einteilung in verschiedene Familien ermöglicht es, bei zukünftigen Suchen von neuen Sequenzen nur noch in der entsprechenden Familie suchen zu müssen, und damit wird der benötigte Rechenaufwand *DRASTISCH* gesenkt. Vergleichbar mit SIMAP. Dadurch erhöhrt sich natürlich auch die Wahrscheinlichkeit, bestimmte Proteine(=Gene) für bestimmte Funktionen (also auch krankheitsauslösende) bestimmen zu können.
Für Laien
Einteilung von Millionen von bekannten Proteinsequenzen in verschiedene Familien, um spätere Klassifizierungen schneller und einfacher vornehmen zu können.
Stichworte / weiterführende Links
HMM = Hidden Markov Models
PFAM = Datenbank für Proteinmodelle, im speziellen für Domänen - Teile von Proteinen mit bestimmten Funktionen.
RMIDb = Rapid Microorganism Identification Database
Derzeit alles HMMPFAM 5.11 Wus.
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Beschreibung
Mittels HMMER werden ähnliche Gen- oder Proteinsequenzen charakterisiert, bzw. Profile davon erstellt, und in Proteinfamilien eingeteilt. Dabei werden bereits bekannte Funktionen als Vorlage genommen, und neu entdeckte, unbekannte Proteine in die gleiche Gruppe klassifiziert.
Im speziellen handelt es sich hier um fast 7 Millionen Sequenzen von rund 41000 Organismen der RMIDb. Diese Datenbank besteht aus Datensätzen von fast allen großen Proteindatenbanken - und mittels hmmpfan wird eine Klassifizierung vorgenommen. Das Problem besteht darin, dass die Datenbanken alle unterschiedliche Kriterien für die Klassifizierung anlegen, und somit eine Neuberechnung erforderlich ist.
Die Einteilung in verschiedene Familien ermöglicht es, bei zukünftigen Suchen von neuen Sequenzen nur noch in der entsprechenden Familie suchen zu müssen, und damit wird der benötigte Rechenaufwand *DRASTISCH* gesenkt. Vergleichbar mit SIMAP. Dadurch erhöhrt sich natürlich auch die Wahrscheinlichkeit, bestimmte Proteine(=Gene) für bestimmte Funktionen (also auch krankheitsauslösende) bestimmen zu können.
Für Laien
Einteilung von Millionen von bekannten Proteinsequenzen in verschiedene Familien, um spätere Klassifizierungen schneller und einfacher vornehmen zu können.
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RMIDb = Rapid Microorganism Identification Database
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ich konnte meinen augen nicht trauen
da gab es doch tatsächlich 20 !!! neue WU´s bei mir von TLP
aber ein klick zu diesem thread hat gezeigt das es keine illusion war
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aber ein klick zu diesem thread hat gezeigt das es keine illusion war
MISTAX
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Auf geht's - lasst uns Synergy wegrocken ich will endlich wieder einen 3x Nr.1 Verteidigungsthread
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Wie lange dauerd eine sone HMM Wu bei euch? Vorallem würd mich ein Intel auf 3-3,5GHz interessieren. Gern auch andere Werte.
MfG nookie
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JKuehl
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Auf geht's - lasst uns Synergy wegrocken ich will endlich wieder einen 3x Nr.1 Verteidigungsthread
Du meinst wohl bald 4x1
.
EDIT :
.
Wie lange dauerd eine sone HMM Wu bei euch? Vorallem würd mich ein Intel auf 3-3,5GHz interessieren. Gern auch andere Werte.
MfG nookie
auf dem Quad rund 850 Sekunden, siehe der Post von mir weiter oben mit Bildchen
MISTAX
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Du meinst wohl bald 4x1
Yeeha, grad gesehen dass die Superlinker auch reinhauen - wie geil! Das erinnert an alte Zeiten!
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mein schlepptop hier mit einem 2ghz core2duo mobile braucht 25min pro wu
nookie88
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lol, irgendwas kann doch da nicht richtig sein. Mein System mit nem 3,2GHZ X2 5000+ braucht für ne HMM 25min. Der Intel kann doch unmöglich die 1,2GHz durch besseres Design wettmachen. Odre wie seht ihr das?
MfG nookie
MfG nookie
lol, irgendwas kann doch da nicht richtig sein. Mein System mit nem 3,2GHZ X2 5000+ braucht für ne HMM 25min. Der Intel kann doch unmöglich die 1,2GHz durch besseres Design wettmachen. Odre wie seht ihr das?
MfG nookie
evtl miese speichereinstellung?
der core2 hat ja auch dicke cache, was TLP zu gute kommt
DonGeilo
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lol, irgendwas kann doch da nicht richtig sein. Mein System mit nem 3,2GHZ X2 5000+ braucht für ne HMM 25min. Der Intel kann doch unmöglich die 1,2GHz durch besseres Design wettmachen. Odre wie seht ihr das?
MfG nookie
Witzbold, ich brauche 30 min für die HMM, und meine CPU ist sogar etwas höher getaktet und hat 2x1MB L2 mit Niedriegeren Latencen, und die Timmings sind am anchlag, habe sogar die Subtimmings angezogen.
Witzbold, ich brauche 30 min für die HMM, und meine CPU ist sogar etwas höher getaktet und hat 2x1MB L2 mit Niedriegeren Latencen, und die Timmings sind am anchlag, habe sogar die Subtimmings angezogen.
wenn das so ist, dann sind die K8 hier besonders schlecht
DonGeilo
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wenn das so ist, dann sind die K8 hier besonders schlecht
Tja so ist es leider. Aber komisch das sein G2 schneller ist als mein F3. Vllt liegts an meinem doch etwas betagtem Chipsatz, der Stammt ja noch aus DDR1 Zeiten.
MISTAX
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nookie88
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DonGeilo du bist ja auch 4min schneller als ich =)
Also hat der K8 hier anscheinend keine Chance mehr gegen den Core2. Egal, was anderes als den K8 kann und will ich nicht zum crunchen nehmen also weiter rechnen und noch paar MHz rauskitzeln^^
MfG nookie
Also hat der K8 hier anscheinend keine Chance mehr gegen den Core2. Egal, was anderes als den K8 kann und will ich nicht zum crunchen nehmen also weiter rechnen und noch paar MHz rauskitzeln^^
MfG nookie
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Hauptsache wir bleiben dran an #1 ... Die WUs reichen zwar gerade (pi mal daumen gerechnet) bei Weitem nicht für das Zeil aus. Aber die Welle ist spürbar
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Hauptsache wir bleiben dran an #1 ... Die WUs reichen zwar gerade (pi mal daumen gerechnet) bei Weitem nicht für das Zeil aus. Aber die Welle ist spürbar
Wir müssen die Kurve einfach "senkrecht" machen, dann reichen die WUs, weil wir die zu schnell wegcrunchen
Naja, ausserdem müssten ja, wenn man sich die WU-Releases so anschaut in 7-10 Tagen die nächsten kommen...
.
EDIT :
.
Pending credit: 923.24
.
EDIT :
.
Was unrealistisch schien, scheint nun doch möglich, Wetten werden angenommen, wer zuerst die Million erreicht let's make it happen!
Pending credit: 1,076.37
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Was unrealistisch schien, scheint nun doch möglich, Wetten werden angenommen, wer zuerst die Million erreicht let's make it happen!
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Die Wette gilt!
Switching Machines over now!
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Uha? Nochmehr? Geil! *g* Jagst du jetzt krb?
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EDIT :
ui - das war zuviel17.04.2008 04:24:30||Access to reference site succeeded - project servers may be temporarily down.
Serverdestruction?
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krb
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EDIT :
.
ui - das war zuviel
Serverdestruction?
Mich einzuholen ist bei den Downloadgrößen der Lattice-WU's extrem einfach. Es passen halt nur eine gewisse Anzahl durch einen DSL1000.
Der Server geht bei Lattice auch öfter in die Knie. Bisher gab es noch keinen Tag, wo der mal konstant lief und WU's hatte.
MISTAX
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Mich einzuholen ist bei den Downloadgrößen der Lattice-WU's extrem einfach. Es passen halt nur eine gewisse Anzahl durch einen DSL1000.
Der Server geht bei Lattice auch öfter in die Knie. Bisher gab es noch keinen Tag, wo der mal konstant lief und WU's hatte.
Was mich etwas nervt ist das 20per Host Limit; dadurch dass die WUs eben so kurz sind, warte ich beinahe schon auf Leerlaufzeiten, v.a. wenn, wie du sagst, der Server doch ab und an mal nichts mehr macht (wie gerade anscheinend)
Sway Dizzle
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Bei mir steht jetzt bei manchen WU's "abgebrochen durch das Projekt",was hat denn das wieder zu bedeuten?
heavy-Ions@boinc
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bei mir auch, aber nur eine. keine ahnung warum
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Nicht direkt jagen.
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